wyklad 15 proteomika, Biol UMCS, V semestr, Inżynieria genetyczna
[ Pobierz całość w formacie PDF ]
//-->Proteomika:•umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawiewszystkich białek komórkowychZalety w porównaniu z analizą trankryptomu:•analizatranskryptomu komórki – identyfikacja mRNA nieoznacza identyfikacji docelowego białkowego produktuekspresji genu•badającproteom analizujemy ostateczne elementystrukturalne i funkcjonalne komórkiEtapy klasycznej analizy proteomu komórki•dwukierunkowąelektroforeza poliakrylamidową białek•identyfikacjaposzcególnych białek poprzez spektrometrię masnp. typu MALDI-TOFZadania proteomiki funkcjonalnej:•Identyfikacja i charakterystyka białek uczestniczących w złożonychprocesach biochemicznych•Analizaoddziaływań białek z innymi białkami, kwasaminukleinowymi, ligandami niskocząsteczkowymi•Określanie składu i funkcji kompleksów makromolekularnych•Badanie powiązań pomiędzy kaskadami przemian biochemicznych•Poznanie mechanizmów ich regulacjiInterakcje DNA-białko•Technika opóźnienia (reterdacji) migracji fragmentów DNA wżelu poliakrylamidowym –EMSA(electrophoretic mobility shiftassay) lub Gel shif assay•Technika badania odcisku stopy – ang.footprintingPrzykładowe zastosowania:•Badanie oddziaływań czynników transkrypcyjnych wiążącychsię z operatorami, enhacerami, silencerami
[ Pobierz całość w formacie PDF ]